辣椒疫病主要危害叶片、茎和果实。
一、叶片受害症状：发病多在叶缘和叶柄连接处出现不规则暗绿色病斑，水渍状，边缘为黄绿色，多雨高湿条件下发展迅速，常造成叶片腐烂，干燥条件下病斑干枯易破碎。
二、茎基部和茎节受害症状：辣椒茎基部和茎节分杈处发生成段暗绿色病斑，水渍状。茎部多在近地面处发病，病斑初期为暗绿色，水渍状，后出现环绕表皮扩展的暗褐色或黑褐色条斑，病部易缢缩折倒，病部以上茎梗也易凋萎死亡。
三、果实受害症状：辣椒果实受害多从蒂部开始，病斑呈暗绿色水渍状软腐，边缘不明显，很快扩展到全果实，引起腐烂，潮湿时病部覆盖白色霉层，干燥后形成暗褐色僵果。
