进入11月以后，枣树树叶基本落净，苜蓿在遭受霜冻后，也开始萎缩，这时就要施肥和浇冻水了。此期施肥可每株枣树施入腐熟有机肥50-100千克，施肥可采用沟施、穴施或撒施的方法。
1沟施
沟施就是在两树之间，挖一个深度为30-40cm，长为80cm左右的施肥沟，施肥沟一定不能挖的过长，以免伤及树旁的苜蓿。在挖施肥沟时，以露出树的毛细根为宜，把将要施入的有机肥以1：1的比例与土混拌均匀，这样即有利于枣树根系对肥效的吸收，又可防止因肥料浓度过高伤根。将拌好的有机肥施入施肥沟中，覆土并踩实。
2穴施
穴施可在树干一侧1m处挖一个20cm深的小坑，将腐熟有机肥施入小坑中，每个施肥坑的施肥量为2-4千克，然后用土覆盖。这种施肥方法主要用于对4年以下根系不发达的幼树进行施肥。
3撒施
枣树苜蓿立体种植也可采用撒施的方法，撒施的优点是施肥均匀，但用肥量大。这个时期施肥可同时进行浇冻水，浇水时，可连同果园中的苜蓿一同灌溉，此次浇水量要大，以使土层湿润深度达到30cm以上。
由于此时苜蓿已基本干枯，因此这个时期主要是对枣树进行管理。在枣树苜蓿立体种植中，常有目的的将枣树修剪为疏散延迟开心型和自然圆头型。
疏散延迟开心型剪枝目标是：全树高5m左右，主干高1.4m，主枝8-9个，第一层主枝数量3-4个，第二层主枝数量为2-3个，第三层主枝数量1-2个，每个主枝上应留2-5个侧枝。
自然圆头型：树高5m以下，主干高1.3-1.5m，主枝8-10个，每个主枝上留2-3个侧枝。
枣树经过这样修剪后，一是增高了枣树的主干高度，方便人员在树冠下的苜蓿地中进行管理作业，二是保证了树冠面积不过于庞大，防止大面积挡光，影响田中苜蓿的生长，三是留下的侧枝密度适宜，既控制了树型不过大，也能达到丰产的目的。
