牡丹花芽黑褐色干枯有可能是真菌或根结线虫危害引起的，也可能是一些生理性因素造成的，如土壤中缺少钾元素、过分干旱、早春气温太低、种植过深、土壤贫瘠、过度遮荫等。防止牡丹花芽变褐干枯的措施：要查明原因，对症下药。
如果是生理性病害，就要加强栽培管理，选择疏松肥沃、排水良好的沙壤土，合理供水，避免过度干旱。如果是真菌引起的，可用l：1：160等量式波尔多液或45％代森铵水剂1000倍液等喷洒。如果是根结线虫引起的，可以看到牡丹根上产生瘤状突起，大的如黄豆，小的似小米，后期瘤状物变褐腐毁，对牡丹有较大危害。
防治方法：应将病株拔除烧毁，并用药剂进行土壤消毒。土壤消毒药剂可选用40%五氯硝基苯粉剂与80%代森锌可湿性粉剂等量混合，每平方米用药8～10克；也可选用福尔马林溶液(每平方米5毫升)。
