菜心的施肥应根据植株的各个生长期的需要进行。例如：第一次施肥（基肥），在整地时施入腐熟人粪尿1500公斤，或腐熟鸡粪600公斤或腐熟猪粪1500公斤。在定植缓苗后施第二次肥，施入腐熟人粪尿500公斤或尿素10公斤。当植株现蕾时再按上述施肥量追施，促进菜薹的迅速发育。在大部分菜薹采收后再追施尿素10-20公斤，以促进主薹、侧薹的生长发育，并且在生长期每3-5天浇水一次，保持土壤湿润。
此外，如果长期的施入化学肥料及使用农药，一般土壤种所含有的对植物生长有害的无机盐可能会过高，土壤也可能过于酸化而团粒结构性差，造成土壤含氧量、保肥保水能力差。因此，要适当增施有机肥进行改良土壤，增加植物生长所必需的中微量元素。
