防热。保存红薯的适宜温度是10℃-15℃，其中最理想的是12℃-14℃，达到15℃-20℃时，薯块就会发芽、腐烂。红薯刚入窖后15-30天内，薯块呼吸旺盛，散发很多的热量，并且有水气和二氧化碳，容易使窖温升高。这时的管理应以通风散热为主。另外，早春气温回升后，也要及时给薯窖散热通风。
防冻。薯块温度低于10℃后，就会发生冻害，造成薯块萎缩、薯心变硬，皮层下有黑筋，味道酸苦。严重的还会发生"烂窖"。预防冻害的方法：首先是不能让受冻的薯块入窖；其次是在严冬风雪天，井窖要加盖，还要堵塞通气孔。在室内或室外的薯堆，要及早盖上稻草或其他软草，如天气太冷或有雪水，一定要上盖塑料膜，既要保持薯堆温度，又要防止雪水浸入薯堆。
防病。凡有伤痕和病害的薯块不得入窖。首先贮藏前要搞好消毒：用铁锨削去井窖四壁的隔年表土层，然后用500倍的多菌灵溶液喷雾。在把鲜薯往窖内存放之前，还要用1000倍的多菌灵或红薯保鲜液，将薯块投入浸泡，然后捞出放入窖中。
