近年来苦瓜杂种优势的广泛利用，大幅度提高了苦瓜种植户的经济效益，但由于种子经营相当分散，导致市场上的苦瓜种子纯度参差不齐，质量不能得到保证。笔者经过多年的繁制种实践，提出提高苦瓜杂交制种质量的建议如下。
1.选地和整地选择前作为非瓜类作物的肥力水平高、地下水位高，且排灌条件好的壤土种植，隔离条件为周围1000米内不种植其他苦瓜品种。地深耕晒干耙平，按1.8～2米起畦（包沟）双行植。春植株距35～40厘米，秋植30～35厘米。
2.适时播种，合理密植在华南地区，苦瓜制种一般分两造进行。春繁2月下旬至3月中上旬采用育苗移栽方式，3月下旬至4月上旬移栽露地，播种前可用55℃左右温水浸泡种子消毒15～20分钟，待冷却后继续浸种5小时左右，种子沥干后置30～33℃温度下催芽，待种子露白后采用营养钵或营养盘护根育苗。秋繁7月中下旬至8月中下旬通常采用直播方式，苦瓜父母本定植比例通常1∶6～8，可采用父母本按比例分行种植或父母本分田种植。春季一般每亩2000～2200棵，秋季可适当密植。栽植前，适当调整苦瓜父母本播期，使父母本花期刚好相遇。
3.田间管理苦瓜耐肥能力较好，施肥应以有机肥为主，注意氮、磷、钾肥混合施用。苦瓜根系较弱，吸水能力较弱，不耐浸，灌溉以沟灌为宜，尽量不要漫灌，注意排水，土壤相对湿度保持75%～80%为宜。苦瓜蔓长35～40厘米时，及时搭“人”字架。苦瓜主侧蔓均能结瓜，应根据苦瓜品种特性选留主侧蔓结果，剪除多余侧蔓。引蔓和整蔓应在晴天下午进行。在生长期，注意田间检查父母本的纯度，及时清除杂株。
4.去雄及人工辅助授粉苦瓜为雌雄同株异花，花器较小，早上8时左右开放，当天下午4时左右花冠萎蔫。苦瓜留种节位不宜太低。一般在棚架40厘米左右开始授粉。以下主侧蔓结果摘除。苦瓜生产一代杂种种子常不进行束花隔离，在开花期将苦瓜母本的雄花全部摘除，母本株不能留有开放或将要开放的雄花。人工辅助授粉在晴天早上8～9时进行，将刚开放时父本雄花摘下，剥去花瓣，露出花药，直接与刚刚开花的雌花柱头轻轻摩擦。并在花柄上扎线标记。苦瓜可以连续结瓜，一般每株人工授粉4～5朵雌花，选留3～4条种瓜，当母本株留有3条授粉瓜时，适当将主侧蔓的顶芽摘除。
5.适时收获种子待瓜条长到成熟时，即瓜条底部开始变黄或红，用手触捏感觉瓜条柔软，剖开后见瓜瓤灰红，即可摘下取种。
