科学施肥，合理施肥，不仅能提供和补充果树的营养，更重要的是调节各营养元素间的平衡，使营养元素在土、水、气、热、微生物诸因素中，发挥其重要的作用。苹果树对肥料的需求高，在施用常规肥料的同时，根据树体的生长规律和需肥特点，还应搭配如菌肥、微肥、钙肥等高效元素肥，以达到调节营养元素平衡，提高肥料利用率，果品优质增产的目的。
一、有机肥主要包括堆肥、沤肥、厩肥、作物秸秆肥、腐殖酸类肥、微生物肥、无机(矿质)肥和叶面肥以及生物有机复合肥等。
作为基肥在秋季果品采收后(10月上中旬至11月上旬)施入，一般丰产优质果园，按每产1公斤果施入有机肥1.5～2公斤，要求用腐熟的有机肥，施肥时注意肥和表土要充分混匀。混合施入尿素(60公斤/亩)、过磷酸钙(150公斤/亩)、硫酸钾或氯化钾(50公斤/亩)等化肥效果更佳。
二、化肥主要为氮、磷、钾单质肥料、复合肥料和复混肥料。复合肥料分氮磷元素的复合(如磷酸二铵)与磷钾元素的复合(如磷酸二氢钾)两种形式存在，复混肥为氮磷钾三种元素的复合，即常见的果树专用肥。
萌芽前和花后，以追施氮元素肥为主，一般株施尿素0.5～0.75公斤，或施氨基酸复合肥2公斤，促进枝叶生长和开花结果；果实开始膨大到迅速膨大期追肥以磷钾为主的复合肥，配合施铵态氮肥。具体时间段为花芽分化期，初果树株施二铵0.5～1.0公斤，盛果期树株施1.0～1.5公斤；果实迅速膨大期，初果树和盛果树分别株施硫酸钾或氯化钾0.25～0.5公斤和0.5～1.0公斤，可有效提高果实品质。
三、微生物肥又称菌肥，主要有根瘤菌剂、固氮菌剂、抗生菌剂、复合菌剂等。
菌肥一般可通过拌种、浸种、幼苗蘸根、喷根以及生长期喷施的方法施入。作为苹果树基肥施用时，每亩用量40～120公斤，在春、秋整地时和腐熟的农家肥一起施入。作为追肥，施用时应比化肥提前7～10天，用量按化肥做追肥的等值投入。
四、微量元素肥常用主要有硼肥(如硼砂、硼酸、硼镁肥等)、铁肥(如硫酸亚铁，硫酸亚铁铵等)、锌肥(氧化锌、氯化锌等)以及锰肥、铜肥、钼肥等。
根据树龄、树势、树相及土壤、叶片营养元素含量分析来综合判定施用时机，通过叶面喷施及土壤施用两种方式进行。硼肥土施0.5～0.75公斤/亩，叶面喷施浓度为0.1%～0.3%；铁肥如硫酸亚铁土施每亩5公斤，叶面喷施浓度0.3%～0.5%；硫酸锌土施每亩1～2公斤，叶面喷施浓度0.01%～0.05%。
五、氨基酸肥主要以氨基酸液的形式存在，有增强苹果树体抗病性，改善果实品质的功能。
枝干涂肥，一般于3月份涂第一次，间隔15天，连涂3次。幼树涂干时要稀释后使用，不能涂原液，以防烧树。喷雾，5月份以后以喷施为主，喷雾时要喷到叶的背面，以发挥最佳效果。灌根时，营养液稀释300倍后与防治根腐病相结合使用。
六、钙肥常用有乳酸钙、硝酸钙、螯合钙(重钙)、氨基酸钙等，是以喷施为主的使用量最大的中量元素叶面肥。
一般采用叶面喷施，在苹果落花后1个月、果实膨大期、采果前1月左右三个时期喷施500～600倍的乳酸钙或2000倍的重钙，可促进果树花芽分化、果实上色，提高果实的含糖量、硬度和耐贮性。
