小麦各生育阶段均能受害，引起苗枯、茎基腐、秆腐和穗腐，在田间以穗腐最常见。
穗腐：通常在乳熟期于小穗颖片基部出现水渍状淡褐色斑点，病斑逐渐扩大至整个小穗或多个小穗，病小穗或病穗呈枯黄色，潮湿天气在颖片合缝处或小穗基部长出粉红色黏胶状霉层。若穗轴或穗茎受侵染可造成白穗。在病害发生后期，若遇潮湿天气，长粉红色霉层的地方会长出黑色小颗粒。病种子变秕，具粉红色霉层。
苗枯：由带菌种子引起。在幼苗的芽鞘和根鞘上呈黄褐色水渍状腐烂，严重时全苗枯死，病苗残粒上有粉红色菌丝体。
茎基腐：称脚腐。自幼苗出土至成熟均可发生，发病初期，茎基部呈褐色，后期变软腐烂，造成整株死亡。
小麦赤霉病发病特点
在我国北方以玉米—小麦或棉花—小麦为主的轮作区，主要初侵染源为遗弃在田间的玉米根茬、残秆、棉铃和堆放在田边地头的玉米秆或棉花秆等。种子内部潜伏的菌丝体存活率很高，主要引起苗枯和茎腐，但对穗腐无影响。
造成穗腐的主要初侵染源是病残体上产生的子囊壳中的子囊孢子落在穗子上侵染所致，重复侵染主要是分生孢子。带菌残体上产生的子囊壳，一般年份到小麦扬花前均可成熟。因此，除品种本身抗病性外，小麦扬花期遇雨发病就重，反之则轻。同一品种，低洼湿度大的田块较湿度小的田块发病重。
小麦赤霉病防治方法
农业防治。选用抗病品种；做好麦田开沟排水系统，降低田间湿度；清除田间地头的玉米秸秆等病残体。
化学防治。在小麦扬花初期，每亩用80%多菌灵微粉剂50克或可湿性粉剂100克，对水10千克进行喷雾，如果扬花期间连续下雨，第一次用药后7天再用药一次。
