辣椒生长期间要求充足的氮、磷、钾和微量元素。幼苗期虽需肥量不大，但对肥料的质量要求较高，一般以施入充分腐熟的有机肥为主，同时配合施入磷、钾肥，以促进幼苗的花芽分化。当磷肥不足时，花形成迟缓，花少，同时易形成短花柱花。初花期植株开始发育，可适当施入少量氮、磷肥，但施肥不能过多，以免植株徒长，开花推迟。收获期对氮、磷、钾肥需求很大，应加强追肥浇水，提高产量和品质。辣椒的辣味也受氮、磷、钾的含量比例的影响，当氮肥多，磷、钾肥少时，辛辣味低;氮肥少，而磷、钾多时则辣味浓。
辣椒为陆续成熟，多次采收的蔬菜，产量高，需肥量大。在采收期一般每次采收前2天左右追施一次肥。而对越夏栽培的植株，平衡多施氮、磷、钾肥有利于发生新生枝叶，有利于茎秆粗壮，增加植株的抗病性和抗逆性。
