引起水稻花秧的原因有两种：
一、缺素症（缺锌）一般情况下，长期被深水、冷水浸没的老稻田容易引起缺锌症。锌在植物体内代谢是催化剂，它促进叶绿素合成和生长素的形成，是多种酶的组成部分，参与碳水化合物的合成与转化，水稻缺锌，植株内叶绿素合成受阻，就易形成白秧、花秧。缺锌引起的花秧，可在移栽时每亩施用0.5－1㎏的锌肥就可以防治花秧的产生，现阶段也可每亩用0.1㎏的锌肥兑水喷雾（2－3壶水）。
二、条纹叶枯病水稻的条纹叶枯病，是一种病毒病，病毒植株被传毒媒介（灰飞虱）叮咬后，而使水稻植株感染的一种病害。植株感病后无明萎缩，但分蘖减少，一般在心叶及心叶下第一叶片茎部出现裉绿的黄色斑纹，逐渐向上扩展，有时连成不规则的黄色（后变成枯黄色）条纹，使叶片质薄且弱，心叶常扭卷成纸捻状或枯死，造成假枯心，老叶不表现症状。发病早的病株多提早枯死，后期发病的叶片扭卷较小、剑叶及剑叶鞘褪绿成黄色或枯黄色，病穗常紧包于叶鞘内不易抽出，似“枯孕穗”，能抽出的也扭曲畸形，不结实，对产量影响较大。该病只能由灰飞虱及灰飞虱的卵传至下一代，种子、病草、病汁液及土壤不传病。由于该病是由害虫传播的，只要做好稻飞虱的防治工作山就能有效的预防该病的发生，可用敌敌畏、乐果1500倍液喷雾2－3次防治稻飞虱。植株感病后，用人工方法，拔出中心病株，再用30%大托粉剂兑水喷雾防治。
