棉花枯萎病是一种真菌病害，棉花枯萎病从子叶期开始就可发病，病株矮小，蕾铃脱落率高，单株结铃数下降，铃重减轻，棉纤维强度下降，从而影响棉花产量和品质。病害严重的1—2片真叶时即可造成死苗。现蕾期发病高峰时可成片死苗。其症状随环境条件、棉花品种类型、棉花生育期、病原致病力等因素的不同而异。大致可分为5种类型：
(1)黄色网纹型其典型症状是叶脉导管受枯萎病菌毒素侵害后呈现黄色，而叶肉仍保持绿色，多发生于子叶和前期真叶。(2)黄化型一般从子叶或真叶边缘开始，叶肉褪色变黄。(3)紫红型一般在早春气温低时发生，子叶或真叶的局部或全部呈现紫红色病斑，严重时叶片脱落。(4)青枯型病株在突然失水情况下出现的症状，尤其在干旱气候条件下，遇到骤雨，之后遇高温强日照，病株叶色深绿，叶片变软下垂，植株青枯死亡。(5)皱缩型叶色深绿，叶肉增厚，叶片皱缩，节间缩短，植株矮化，常与网纹型和黄化型症状并存。
棉花枯萎病菌可在土壤中或棉株残体上进行腐生生活，又可在棉株内进行寄生生活。既能随运输工具远距离传播，又能随作业、流水近距离扩散，造成病菌在土壤中不断扩散和积累，加重发病率和为害程度。病菌可在土壤中存活6—7年，厚垣孢子存活甚至长达15年。病菌由棉苗根尖侵入棉株，在导管中大量繁殖的菌丝及棉株受病菌刺激产生的物质，阻碍水分运输;小型孢子随棉株体液向上扩散至全株，破坏棉株细胞，影响棉株生长发育
防治措施
1、种植抗病品种，是利用棉花品种自身遗传抗病性和耐害补偿功能，控制棉花枯萎病和黄萎病的发生、发展和为害的一个重要途径。
2、采取合理的轮作倒茬。轮作可以减少土壤中的病原菌，降低苗期发病率，并有利于棉苗的生长。此外，棉种棉饼消毒、用无菌土育苗移栽、年年清洁棉田等措施，也可减轻病害的发生和为害。
3、重视发展棉麦间作和夏播短季棉。利用生态条件控制棉花枯萎病和黄萎病发展为害。棉花枯萎病在气温23—26℃条件下发病严重，但当温度高达26℃以上，则症状隐蔽，病势趋于缓和。
4.中耕锄划，应坚持由浅入深的原则，做到勤中耕、细中耕。
5.历年发病严重的棉田要晚定苗。病重棉田要在枯萎病发病高峰期过后再定苗，以防造成缺苗断垄。
6.有效的药剂防治措施。萎菌清、黄腐酸盐类灌根，克黄枯、甲基托布津等农药，加入1%尿素水喷雾防治。
7.补救措施。对因枯萎病早发造成缺苗断垄的棉田，可在6月上旬发病高峰过后，采用大苗移栽的办法进行补救。
