1.砧木的选择冬瓜、黄瓜和西瓜不宜作苦瓜的砧木。普通南瓜品种虽然可作苦瓜的砧木，但多数品种嫁接后的成活率不高；以葫芦为根砧嫁接后虽然成活率高，但嫁接苗易患根腐病，生长势差，早衰严重，生育期大大缩短；以丝瓜为砧的嫁接苗，不仅嫁接后成活率高，而且生长势旺盛。目前生产上用的较多的是台湾农友种苗公司的根砧品种“双依”。该品种与苦瓜的亲和性好，抗苦瓜的枯萎病，又耐根结线虫病，苦瓜嫁接后生长旺盛，结果早而多，为苦瓜的理想根砧。另外也可用农家的肉丝瓜品种。丝瓜砧多用于劈接和顶劈接。还可用“壮士”、“共荣”和黑子南瓜等南瓜砧，南瓜砧多用于靠插接。
2.靠插接砧木和接穗均采用子叶苗。苦瓜种子皮厚而硬，采用常规法催芽出苗迟，发芽率低，故要采用温汤浸种。用55～60℃的温水浸种10～15分钟后，在30℃水温中浸种12～24小时，反复擦洗后装入透气纱袋，在30℃催芽，经3～4天约有80%种子露白时即可播种，播种在阳光充足的大棚内，土壤无枯萎病菌。黑子南瓜出现第一片真叶、苦瓜1叶1心时为嫁接适期。用嫁接刀片将黑子南瓜幼苗茎向下呈40削一长度为1厘米的切口，深及茎粗的2/3，将二者切口插在一起，并夹上嫁接专用夹。嫁接后头1～3天全天遮光，保湿。3～7天，每天10∶00～15∶00时遮光，其余时间照散射光，室内白天保持32℃，夜间保持20℃，湿度90%左右。7天后按常规管理。10天后检查嫁接处，如成功则可接口处将苦瓜根切断。同时降温炼苗，白天维持温度25℃，夜晚15℃。靠插接砧木带根，成活率高，管理方便，初期生长较健壮，具有相当抗病能力，增产显著。但接穗苦瓜苗易接触土壤，要注意防接触土壤而引起枯萎病、根腐病侵染。
3.顶劈接苦瓜接穗品种尽可能比砧木品种丝瓜早播、早出苗，以提供较多的接穗。当苦瓜苗生长到适当时期，用火焰消毒过的刀片切除顶芽，使其生长更多的子蔓，供切取接穗，若发现苦瓜感染病毒病或其他病害，须马上清除，尽量保证健康的母株。同时在大棚内培育健壮的丝瓜苗，丝瓜有一片真叶时为嫁接适期。选择阴天或晴天的傍晚时嫁接。嫁接前2～3小时，先将砧木苗床浇湿，用消毒过的刀片切除丝瓜的生长点及真叶，仅留2片子叶，再纵切2片子叶中间的胚轴，深约1.0～1.5厘米。从苦瓜母株上切取叶片未开张的子蔓末梢一节。将从母株上切取的苦瓜接穗的茎两侧削成双楔形，长约1.0～1.5厘米。将削好的苦瓜接穗插入砧木丝瓜剖开的胚轴中，用嫁接夹夹住，使砧穗密接并固定位置。将嫁接苗移置于遮光的塑料棚内，不需要浇水，保持较高的湿度，约1周后接穗已成活，再移置透光的大棚内，按一般的方法培育管理，1个月后即可定植。
