膜下滴灌技术是一项适合设施蔬菜灌溉的先进节水灌溉技术。具有节水、节能、增产、省工、省地、省肥等优点，但是在实际应用中还存在着以下几方面的问题。
1、种植户操作方法不规范
由于滴灌属“浇作物”的灌溉方式，注重少灌勤灌，种植户对作物何时灌水、一次灌多长时间、如何滴灌施肥等问题及完全理解和准确掌握操作要领还存在随意操作、管理粗放的现象。
2、换种密植作物后灌溉不匹配
温室膜下滴灌主要适用于番茄、黄瓜等行栽蔬菜，滴灌管大多按这些作物行距布置。当换种为密植作物时，滴灌管行距、行向不能随之改变，导致滴灌管闲置，影响了滴灌作用的充分发挥。
3、滴头堵塞，影响灌溉效果
膜下滴灌要求灌水均匀度达到90%以上，而滴头堵塞是影响灌水均匀度的直接因素。导致滴头堵塞的原因主要有包括水源过滤不彻底带来的杂质堵塞；使用肥料不当造成的肥料沉淀堵塞；施肥后没有及时用清水冲洗管道，滋生微生物和藻类等引起的堵塞。
4、维护滞后，影响工程运行
在温室膜下滴灌运行中，由于缺乏必要的维修管理资金，加之受重建轻管思想的影响，导致使用过程中维护检查落不到实处。当出现管网损坏漏水或设备故障后，存在不会修理，或在当地买不到可供维护替换的器材，水源首部或主管路故障，甚至无钱购买配件等，使设备得不到及时修理，影响工程正常运行。
