果树开春后根、枝、叶、花、果各器官的生长发育主要消耗的是树体贮藏营养。如果树体贮藏养分足，各器官生长就健壮，坐果率就高;如果贮藏营养不足，即使春季施肥也无济于事，营养生长和开花坐果都会受到抑制。所以，增加上年秋季树体营养贮藏水平对当年生产具有重要意义。
而秋季土温尚高，墒情较好，有利于土壤微生物活动，施入的有机肥腐熟快，化肥转化快，果树的地下根系又处于生长和吸收高峰，地上叶片多而成熟，光合作用强烈，秋季施肥就可起到地下地上双促进，更有利于光合产物的合成与积累。
因此，秋季施肥对促进根系吸收能力，延长叶片光合寿命，提高光合作用，增加营养储备都具有重要作用。根据果农施肥存在的突出问题，果树秋施基肥要五改：
一、改晚为早
一般，果树秋梢停长后进入根系生长高峰期，此后施肥越早越好。施基肥要改晚熟品种采收后的晚秋施和冬初施，为中熟品种采后施和晚熟品种采前施。
嘎拉苹果、红香酥梨等中早熟品种，以8月下旬至9月中旬施入基肥最佳;红富士苹果、砀山酥梨、红提葡萄等晚熟品种，以9月施入基肥效果最佳。为方便操作，可在采果前人工穴施或沟施商品性袋装颗粒肥，腐熟粪肥以采果后人工或机械翻施为宜。
二、改偏为全
有机肥、化肥、菌肥、微肥，四者在沃土、增产、提质、节本方面均有特定功能，具有同等重要和不可替代的作用。按需施用化肥是一方面，更重要的是通过合理利用有机资源，实现有机无机相结合。以大量元素氮磷钾促进高产，以中微量元素提升品质和减轻生理病害，以农家肥培肥土壤和提高果品品质，以微生物肥料改善和净化根际环境以提高根系活力等，实现果树优质丰产，土壤肥沃健康，结果盛期延长之目的。
三、改近为远
一般果树的水平根分布范围是树冠直径的2~4倍，80%的吸收根分布在树冠外围枝的垂直投影边缘区域。苹果、梨、桃、樱桃、冬枣等果树开沟或挖穴施肥的合理位置，应在树冠外围垂直投影外沿，不宜距离树干太近。
四、改浅为深
多数果树属深根性植物，在垂直方向上吸收根具有成层分布的特点。苹果、梨等仁果类果树根系的集中分布层一般为20~80厘米土层，桃、杏、李、樱桃等核果类为20~40厘米土层。初果期树5~30厘米土层为吸收根密集区，盛果期树10~50厘米土层为吸收根密集区，这就要求根据不同树龄，把80%的肥料施在吸收根密集区。
五、改堆为散
肥料在施肥穴沟堆积，局部浓度过高，会诱发根腐病。正确的做法是，先在沟底施入有机粪肥，再回填表土，然后将肥料均匀撒入施肥穴，并用耙将肥料与粪肥和表土充分混合均匀，最后在最表层覆盖底土即可。
此外秋季施肥要注意，农家肥一定要经过腐熟，化学肥料要与土壤进行混拌，防止肥料腐熟产热或局部浓度过高造成对根系的伤害。
