番茄在生长过程中，由于缺乏某种营养元素或受不良环境的影响，造成植株生长发育失调，果实出现种种症状，常见的有以下几种症状。
1、畸形果畸形果表现的形态很多。有的是果实变形，呈椭圆形、尖桃形，有的在果柄基部有瘤状突起，有的果脐开裂，种子向外翻卷裸露。主要是幼苗花芽分化时期，长期处于较低的温度条件下，容易使果实发育成多心室的畸形果；或施氮肥过多及浇水过多，产生脐裂状畸形果；使用生长素浓度过高，水肥管理又没跟上，会引起子房畸形发育而形成瘤状果或桃形果。
为防止畸形果的发生，育苗期间温度不宜控制过低，第一穗花的花芽分化前后要避免连续遇到10℃以下的低温。施肥时要注意氮、磷、钾的配合，避免氮肥过多，使用生长素浓度不要过高，并加强水肥管理。
2、裂果番茄的裂果现象，有环状开裂，放射状开裂和不规则的侧面裂果。一般大型果品种裂果较多。由于在果实肥大初期，高温、强光及土壤干燥促使果肩部表皮硬化，而后又因降雨或大量水分急剧增多，使果皮生长跟不上果肉组织的膨大，使膨压骤然加大，产生裂果。
为了防止裂果，除选择抗裂果的品种外，主要是在结果期应注意保持土壤湿润，水分供应均匀，防止过干或过湿，多雨季节，应及时采收。
3、日灼病在夏季高温季节，由于强光直射，引起果皮温度过高而灼伤，呈白绿色，干缩变硬，略显凹。
防止日烧的措施是增施有机肥，增强土壤保水力，适当密植，使枝叶遮盖果实，防止阳光直晒果实。
4、空洞果果实的胎座组织产生不充实，果胶物质相应减少，果皮与胎座组织分离，种子腔成为空洞，空洞果多出现在生长后期，产生的原因，结果期间温度过高或过低，阳光不足，体内碳水化合物的积累少，受精不良，种子退化；氮素施用过多或土壤瘠薄，植株营养不良；使用生长素浓度过高，花蕾过小，均易产生空洞果。
为了防止出现空洞果，应注意调节营养生长和生殖生长的平衡，保证果实发育获得充足的营养，并应创造适宜的条件，使授粉受精正常进行，要注意使用生长素的浓度。
5、脐腐病多发生在果实膨大盛期。顶部变为黑褐色，病斑向里凹陷，多木质化，如遇雨或湿度较大时，则易引起病菌寄生而腐烂。脐腐的发生是由于果实组织中缺钙的结果，同事土壤干燥，水分不匀，过湿过干，空气过于干燥，以及土壤养分浓度过高，由渗透压引起的脱水都能产生脐腐。此外土壤过于粘重，使用酸性肥料过多，也是致病的一个原因。
防治措施是深耕及多施有机肥，增加土壤的保水力；施肥时注意土壤溶液的浓度，适当控制氨态氮的用量；喷施0.5-1.0%的氯化钙溶液，尽量避免水分的激烈变化及温度过高。
6、条腐病症状有两种类型，即褐变型（果实内维管束及其周围组织褐变）和白化型（果皮或果壁硬化、发白）。是由于多种不良条件诱发的生理病害。幼果期光照不良，果实肥大期土壤条件差（如施用未腐熟的有机肥，钾、硼缺乏，氮素特别是氨态氮肥过多，通气不良），以及夜温高，病毒病等都可能综合影响导致发病
为防止条腐病的发生，应特别注意各种应养成分的配合施用，适当增施钾肥，氮肥以硝态氮为主；在管理上注意搞好田间排水工作，改善土壤通气状况。
