一、棉花蕾、花期旺长
地膜栽培由于环境条件的改善，生育期提前，蕾期、初花期往往与梅雨季节相同步，容易导致棉花生长过旺。如果化调措施不及时，营养生长过旺，后期田间荫蔽加大，脱落增加，造成棉花增产不显著，甚至会出现减产减收。
二、烂铃数量增大
地膜棉由于早桃增加，伏桃比重增大，棉株中下部结铃增加，吐絮期提前，烂铃明显增多，不利于高产和提高前期花的品质。
三、棉花后期易早衰
地膜棉由于生育期提前，亩成铃数增加，对土壤养分的需求量加大，常规施肥方法不能适应其生长要求，在生育中后期容易出现早衰。这是制约地膜棉高产的突出因素。
四、虫害、草害发生早，抗倒、抗渍性较差
棉田覆盖地膜后，草害发生早，发生量大。地膜棉生育进程早，植株前期嫩绿，中期健壮，虫害发生早而重，一旦防治失时，就会造成危害。地膜棉根系较浅，抗倒能力差，多雨年份易发生渍害。
五、白色污染严重
目前生产上使用的大多是普通聚乙烯地膜，在自然条件下难以分解。主产棉区长期使用地膜覆盖易造成“白色污染”，将对土壤环境造成严重污染，对农业生产构成威胁。：及时清除残膜，或是选用可降解地膜、液体地膜等对环境友好的新型产品。
