番茄花为完全花，聚伞花序，小果型品种多为总状、复总状花序。花黄色，每朵花由花柄、萼片、花瓣、雄蕊、雌蕊组成。番茄花的每一小梗上有一个环节。当天气过冷、过热、过干、过湿，以致胚珠不能正常受精或因子房受机械损伤时，在这个环节处都会发生离层，因而造成落花。离层的发生是由于产生能溶解细胞间中胶层的酶的结果。使用生长刺激素能阻止这种酶的活动，可防止落花落果。生产上应用防落素、2，4D等激素处理，可有效地防止落花落果。
番茄的花自花授粉，大中果型多为聚伞花序，小果型品种为总状花序。每朵花有萼片、花瓣5～7个；有雄蕊5～9枚或更多，聚合成圆锥体，包围在雌蕊周围，药筒成熟后向内纵裂，散出花粉，进行自花授粉。个别品种或受不良条件影响，柱头外露，可以进行异花授粉。一般天然杂交率在4%～10%之间。进行番茄杂交制种生产时，应摘除长柱头花，以免产生假杂种。每一花序上的花数在品种间差异很大，由5~6朵至20朵。花序上花数多少，与品种特性、栽培环境有关。春季栽培比冬季和夏季花数多，小果型品种比大果型品种花数多。生长过程中经常出现畸形花，表现多花瓣、多雄蕊、宽柱头等，且排列不整齐。畸形花形成畸形果，生产中应及时摘除。根据番茄自花授粉的特性，番茄开花后可采用人工振荡授粉（用振荡器进行），提高坐果率。
按番茄花序着生规律分两种类型：即有限生长型和无限生长型。有根生长类型的品种，一般主茎第6~7片真叶着生第一花序，以后每隔1～2片叶形成一个花序，主茎发生2～4层花序后，花序下位的侧芽停止发育，不再抽枝，也不发生新的花序，即植株封顶，故植株较矮。无限生长类型的品种主茎出现第一花序，以后每隔2～3片叶着生一个花序。条件适宜时可无限着生花序，不断抽枝和开花结果，故植株高大，多为中、晚熟品种。
番茄花的丰产形态：同一花序内开花整齐，花的大小中等，花瓣黄色，子房大小适中。徒长植株的花序内开花不整齐，花的子房特大，花瓣浓黄色。老化株开花延迟，花小，花瓣淡黄色，子房小。
