主要症状：辣椒菌核病在重茬地、老菜区发生比新菜区要严重。辣椒整个长期均可以发病。成株期发病较多，各个部位均有感病现象，先从主干茎基部或侧根侵染，呈褐色水浸状凹陷。主干茎表面易破裂，湿度大时，皮层霉烂。根部感病后，在潮湿条件下长有稀疏白色霉层。叶片染病呈水浸状大块病斑，偶有轮纹，易脱落，感病后期病部凹陷，斑面长出白色菌丝体，后形成菌核。
防治方法：在发病中后期，霉止50ml+40%嘧霉胺悬浮剂10—15g或碧秀丹（氯溴异氰尿酸）30g或丙环唑10ml或40%腐霉利可湿性粉剂15—20g或乙霉多菌灵20g兑水15公斤，3—5天用药1次。霉止50ml+10%多抗菌素15g或10%苯醚甲环唑水分散粒剂35g或70%百菌清30g，兑水15公斤，3—5天用药1次。霉止50ml+40%菌核净可湿粉剂20g或40%腐霉利可湿粉剂15—20g，兑水15公斤，3—5天用药1次。
