一、苗期受害症状：1、黄色网纹型：棉花枯萎病早期典型症状。棉株子叶或真叶多由叶缘或顶部开始，叶脉褪绿变黄，逐渐向内扩展，叶肉部分仍保持绿色，叶片局部或全部呈黄色的网纹。最后叶片调萎、干枯、脱落，植株死亡。
2、紫红型：子叶和真叶全部变成紫红色或局部出现紫红色斑块，随之叶片枯萎、脱落，棉株死亡。紫红病部的叶脉，也呈现红褐变色。
3、黄化型：子叶或真叶多从叶缘开始，出现黄色或淡黄色斑块，但不呈现网纹，随后逐渐变褐枯死。叶柄和茎导管变褐。
4、青枯型：叶片急性失水，青枯萎蔫致死，但叶片并不脱落，植株仍保持青绿色。有时仅半边植株青枯萎蔫。
5、皱缩型：受害棉花植株节间缩短，叶片深绿变厚皱缩不平。病株比健株明显变矮，但并不枯死。黄色网纹型、黄化型和紫红型的病株，都可出现皱缩型症状。枯萎病株的共同特征：根、茎内部的导管变成黑褐色。
二、成株受害症状：成株期症状多样，常见的是植株矮缩。病株叶片深绿皱缩，叶片变厚，叶缘向下卷曲，主茎和果枝节间缩短，有时扭曲。有些植株半边表现病态，另半边仍可生长，形成半边枯萎。重病株早期枯死，轻病株虽可带病存活，但产量受到严重影响。茎杆、叶柄和根部的导管均变成褐色。秋季多雨时，在枯死茎杆及节部产生粉红色霉层。
