食用标准不同，采收期也不同，萝卜芽是含水量高的嫩芽，应及时采收和销售，长时间脱水，引起品质下降。食用子叶的萝卜芽，一般播种后6至8天可以采收，食用2片真叶期芽苗的，需14至17天。采收最好在清晨和傍晚，温度较低时进行。地床栽培的，收获后清洗根部泥沙，捆扎时不要过紧或过松，要尽量避免损伤萝卜芽的嫩茎。在一般情况下，水培苗盘生产的萝卜芽菜以整盘出售，可用小刀齐盘底垫纸处割下，用16厘米乘以27厘米的保鲜袋分装，每袋300至400克，包装封口上市，不能及时上市销售的产品应放入4至10摄氏度的冷柜或冰箱冷藏室内贮存，一般贮存的好可放半个月。
