一、土壤本身土壤中微量元素的多少受土壤成因的影响，不同类型的土壤成土母质不同，所以含微量元素不同；多年种植同一种作物的土地，某元素大量消耗是微量元素缺少的原因之一。
二、pH值的影响土壤酸碱度是影响微量元素有效性的重要因素。试验表明，氮、磷、钾、钙、镁、硫pH值在6—8之间，会引起缺铁、锌等症；而在酸性土壤上植株易出血缺钼症状。
三、偏施化肥一般偏施氮肥会影响钙的吸收，使植株表现为缺钙症状；偏施钾肥，会影响植株对硼的吸收，出现缺硼症；偏施磷肥易引起缺铁、锌等症。
四、有机肥施用量少目前菜田的微量元素主要通过施入有机肥来补充，而有机肥用量少，使本来缺素的土壤中的微量元素进一步缺乏。
