一、种子形态测定法
玉米种子纯度的形态测定，分为幼苗形态测定和籽粒形态及植株形态测定。玉米幼苗形态测定主要依据芽鞘的颜色，可分为绿鞘和紫鞘两大类。玉米籽粒形态测定，依据籽粒的粒形(马齿形、半马齿形、硬粒型)、粒色(白色、黄色、红色、紫色)深浅、稃色(白色、浅红、紫红)深浅、籽粒上棱角的有无及明显程度、胚的大小、形状、胚部皱褶的有无、多少、花丝遗迹的位置与明显程度等，可以对大多数玉米杂交种中的杂粒进行区别。区分自交粒所依据的性状主要由粒色和籽粒顶部的颜色。
二、电泳检测法
主要利用电泳技术对品种的同工酶及蛋白质组合或DNA和RNA的指纹进行分析，找出品种间差异的生化指标，以此区分不同品种。使用电泳检测需要配制试剂，提取样品，制胶，上样电泳和染色观察五个步骤。
三、小区种植鉴定法
采用田间小区种植鉴定是正确评价种子真实性和品种纯度的可靠方法，一般用作于种子贸易中的仲裁检验。小区种植鉴定的方法要掌握好三点：第一，收集标准种子样品，最好是育种家种子或能代表品种原有特征特性的原种。第二，设置种植小区，要求小区在同块地，土壤肥力一致均匀，前茬未种过玉米，每个样品最少设2次重复。第三，种植株数及管理，种植的株数依据杂交种纯度而定，纯度越高种植的株数应越多，如98％的一级杂交种纯度，种植株数不少于400÷(100-98)=200株；小区管理与大田生产不同之处就是不间苗。穗花期和成熟期各鉴定一次，将小区发现的异品种、异作物记载下来。
四、玉米种子水分含量测定
该测定主要是指种子样品中含有的水分重量占种子样品重量的百分率。通常用烘干减重法测定水分占样品湿基的重量。即：种子水分％=[(样品重-烘干重)÷样品重]×100。
