马铃薯晚疫病发病快，病程短，危害重，要通过综合防治措施有效控制其危害。
推广抗病脱毒种薯在加强田间马铃薯品种抗病性监测基础上，选择抗性强的品种生产脱毒种薯，大力推广应用一级脱毒种薯进行商品薯生产，同时要做好种薯处理。种薯出窖时淘汰病烂薯，播种切块时，切刀用酒精或高锰酸钾液或福尔马林浸泡消毒；种块可选用精甲霜灵锰锌可湿性粉剂或霜脲·锰锌可湿性粉剂等药剂拌种，旱作区也可用马铃薯专用浸种剂（如复合微肥稀土旱地宝等）加甲霜灵锰锌可湿性粉剂浸种，拌药和浸种种薯均需避光晾晒2小时以上方能播种。
健身栽培重视推广高垄栽培，合理密植，适时播种，科学轮作等健身栽培措施，尤其在雨水多、墒情好的地方，可采取垄上播及平播后起垄等方式，降低薯块带菌率；避免与茄科类、十字花科类作物轮作或套种，禁止与番茄轮作。
中心病株处理加强调查，当发现中心病株时，要连根及种薯块全部挖出，带出田外深埋，深度1米以上，病穴撒石灰消毒，对病株周围50米范围内喷施甲霜灵锰锌或霜脲·锰锌等药剂进行封锁控制，隔10天喷1次，连喷3次，阻止病害扩展。
药剂控病现蕾后加强定点监测和大田普查，现蕾至开花初期，在连阴雨来临之前喷施1~2次保护性杀菌剂，如代森锰锌（全络合态）、丙森锌、双炔酰菌胺等进行预防；田间见病后，重发区立即选用内吸性杀菌剂，如精甲霜灵、霜霉威、烯酰吗啉·锰锌、氟吡菌胺·霜霉威等药剂喷雾防治2~4次，常发和偶发区根据监测预报选用上述药剂防治1~3次或申嗪霉素、枯草芽孢杆菌等生物制剂防治。喷药力求均匀，若喷药后6小时遇雨，应及时进行补喷。应特别重视轮换用药。
