黑斑病为彩色甜椒的常见病，分布广泛，发生普遍，保护地、露地种植都可发生，通常零星发病，病情较轻，对生产无显著影响，严重时病果率可达30％以上。
【症状】此病主要侵染果实，多侵染过度成熟的果实或日灼病果。病斑初呈淡褐色，不规则水浸状，稍凹陷，逐步发展或几个病斑愈合形成大型坏死斑，其上产生黑色霉层，即病菌分生孢子梗和分生孢子。
【发病规律】病菌主要在病残体上越冬，亦可在其他寄主上为害过冬。病菌的寄生能力较弱，过度成熟或生长衰弱的果实容易染病，发生此病与日灼病的发生轻重有关，多发生在日灼病斑处。制种田块发病较重。
【防治方法】1.适时采收，防止过度成熟。2.加强管理，防止彩色甜椒出现日灼病果。3.制种田块后期，或发病初期喷洒50％扑海因可湿性粉剂1500倍液，或40％克菌丹可湿性粉剂400倍液，或70％代森锰锌可湿性粉剂500-600倍液，或75％百菌清可湿性粉剂600倍液，710天防治1次，视病情防治1-3次。
