1、为害症状
小球菌核病和小黑菌核病症状相似，初期在近水面的叶鞘上形成黑褐色小病斑，然后向上、下扩展成为黑色的细条线。病斑在扩大的同时，病菌浸染到叶鞘内部及茎秆，生成同样的黑色条斑，最后使茎秆基部变黑腐朽。病株上部失去光泽、叶片青萎、枯黄，稻穗发白，谷粒空瘪；重时病株软化，倒伏。剥开病部可见叶鞘和茎内有无数黑色细小菌核。病较轻者，茎基节间淡褐色，茎内仅见白色菌丝。灰褐色，边缘褐色，分界明显，茎部受害变褐枯死，一般不倒伏。后期在叶鞘组织或茎杆内形成小的球形或圆柱形菌核。褐色菌核病侵害稻的叶鞘和茎。病斑褐色椭圆形，常相互连接成大病斑，中心灰褐色，边缘褐色，分界明显。茎部受害变褐枯死，一般不倒伏。后期在叶鞘组织或茎秆内形成小的球形或圆柱形的菌核。
2、发病特点
病菌的菌核在稻草、稻桩上或散落在土壤中越冬。第二年整地灌水时，菌核浮在水面，当气温回升时，菌核萌发产生菌丝，病菌可由叶鞘的表面直接侵入或由伤口侵入，依靠气流或稻飞虱、叶蝉等传播，使病害不断扩展。病菌发育适合温度，小球菌核为25～30℃,小黑菌核为25～32℃，褐色菌核为30℃，在双季稻区如5～6月及8～9月降雨多，湿度在90％以上，有利于发病；氮肥施用过多过迟是引起发病的重要原因；田间后期脱水过早，特别是孕穗到抽穗灌浆期田间缺水，遭遇干旱，会加重发病；长期深水、排水不良的田块发病也重。稻飞虱、叶蝉等为害削弱了水稻的抗病力，将加重菌核病的发生。
3、防治方法
（1）农业防治。
选用抗病良种，特别是加强肥水管理，是防治菌核病的关键。肥水管理同稻瘟病。如发现稻株失去光泽，稻穗发白，出现萎焉现象，应立即灌水抢救，以减轻发病。
（2）药剂防治。
拔节孕穗期结合调查纹枯病时，如发现菌核病为害蔓延时，可用70％甲基硫菌灵可湿性粉剂每亩50克，或50％多菌灵可湿性粉剂每亩75克兑水喷雾，或用10公斤生石灰拌细土撒施。注意药液喷至下部叶鞘上。
