黄瓜的茎大都是蔓生的，是攀援性蔓茎，五棱，中空，上有刚毛，每节着生一片叶，叶腋有卷须、腋芽或花芽原基，在4～5片叶以前茎直立，以后如无支架支撑即倒伏，所以生产上一般都要支架引蔓。当基部长至5~6节时，节间开始伸长。黄瓜茎多为无限生长型，长度多在2米以上，主要取决于品种和温度、营养、水分等栽培条件，一般早熟品种茎较短，而中、晚熟品种茎较长。但有些品种是矮生的，属于有限生长型。茎蔓长度最短的仅30厘米。
黄瓜主蔓上可以长出侧蔓，侧蔓上还可以再生侧蔓。侧蔓数目的多少与品种和栽培条件有关，一般生长势强的中、晚熟品种多于早熟品种。通常，顶端优势强的极早熟品种和早熟品种瓜蔓短，不发生或很少发生侧枝，多以主蔓结瓜为主。顶端优势弱的中、晚熟品种瓜蔓长，分枝也多，有的采用侧蔓结瓜，有的主、侧蔓结合结瓜。摘心往往能促使侧蔓的发生。在栽培上，对主蔓结果型的品种进行多次摘心，可以达到早熟、增产的目的。
黄瓜幼苗一出土，幼茎便对光和温度很敏感。如果这个时期持续高温和光照不足，则茎将徒长，并对以后的生长带来不利的影响。因此，出苗后要给以充足的光照，及时通风，并保持一定的昼夜温差，才能促使幼茎粗壮。幼茎粗壮而不徒长，是健壮幼苗的标志之一。
黄瓜茎的粗细、节间的长短和刚毛强度等是衡量植株健壮程度和产量高低的主要标志。它在很大程度上受制于温度、营养和水分等因素的影响。温度高，光照弱，特别是夜温高时，节间细长，植株徒长。夜间温度过低容易引起黄瓜的节间变短。茎蔓不发达，很难获得高产。茎蔓过分粗壮，属于营养生长过剩，也人支影响生殖生长。
