当池塘中有大量的悬浮物和底泥污染水源时，便可使用芽孢菌调水。芽孢菌含有丰富的蛋白酶、脂肪酶和淀粉酶等，能分解池塘中的悬浮物和底泥，改善水质以及周围环境，维持水的生态环境平衡，还具有改善池塘水质、去除池塘中的氮与硫、分解淤泥以及使水体净化的作用。
一、什么情况下使用芽孢菌调水
1、改善池塘水质
（1）芽孢杆菌通过酶的作用，能分解池塘的悬浮物和底泥，维持水生的生态环境平衡，将芽孢杆菌投入养殖池中，能降低水中的COD、BOD，改善水质和周围环境。
（2）芽孢杆菌具有丰富的蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶、纤维素酶、脱氢酶、脱羧酶和氧化酶等能强烈的分解碳系污染物，能分解蛋白质和复杂多糖，并对分解水溶性有机物也有重要的作用。
（3）池塘中的悬浮物是由有机碎屑、细菌、藻类和矿物质等细微颗粒组成的胶粘状物，而底泥由有机碎屑、细菌和藻类组成。
2、去除池塘中的氮与硫
（1）在池塘中用芽孢杆菌为主导菌的复合微生态制剂，含活菌数为109个/g，首次用量为1.5-5.0mg/L，能增加溶解氧量，降低H2S、NO2-N等，改善养殖环境。
（2）高密度集约化养殖严重污染塘的生态环境，过量的氮与硫引起池塘富营养化，在池塘中形成了对水产动物有害的H2S，影响动物生长，甚至死亡，而芽孢杆菌能够利用酶，强烈分解氮系和硫系污染物，净化养殖水体。
3、分解淤泥
用芽孢杆菌为主的微生物复合制剂，能够分解淤泥，降解有机碳。
4、水体净化
芽孢杆菌具有絮凝作用，可将水体中的有机碎屑粘连在一起，从而构成菌胶团，共同担负氧化分解的任务，把有机物结合成絮状，沉淀重金属离子以及P元素，达到水体净化的目的。
二、芽孢菌多少度能杀死
1、一般温度121-126℃且持续30分钟，就能将芽孢菌杀死。芽孢菌是细菌一科，能形成芽孢（内生孢子）的杆菌或者球菌，对外界有害因子抵抗力强，分布广，主要存在于土壤、水、空气以及动物肠道等地方。
2、芽孢对热、放射线和化学物质等有很强的抵抗力，能除臭驱蝇，减少污染，控制细菌性疾病，减轻环境污染。
3、芽孢菌与低浓度抗生素同时使用，但不能与杀菌剂、消毒剂、化学药品、农药等同时存放或使用。
