辣椒是需肥较多的蔬菜之一，无公害生产辣椒应根据无公害生产标准要求和土壤肥力的高低施足底肥，依据辣椒不同生育期的需肥规律进行科学追肥。
1、施足底肥。每667㎡撒施或沟施充分腐熟优质农家肥5000kg、磷酸二铵30kg、草木灰100kg。
2、科学追肥。
2.1轻施提苗肥。辣椒移栽定苗后，结合浅中耕，每667㎡施尿素或复混肥2～3kg，促进植株早发壮苗。
2.2稳施花蕾肥。每667㎡施尿素5～7kg、过磷酸钙7kg，或施生物有机肥15～20kg，以满足辣椒发棵分枝和现蕾开花的需要。
2.3重施花果肥。每667㎡施过磷酸钙20～30kg、尿素10～15kg，或施生物有机肥30～40kg，离主根3～7Cm处。
2.4早施秋肥。立秋前每667㎡施尿素或复混肥15～20kg。
2.5叶面喷肥。在开花期喷0．1％～0．2％的硼砂溶液，0．3％～0．4％的磷酸二氢钾溶液，每667㎡喷液肥50kg左右。开花期用25～30mg／kg防落素喷花，能够防止落花、落果、落叶，并能增加早期产量。
3、巧施微肥
易得脐腐病的田块，可施钙肥，酸性土壤，每667㎡可施氨基酸钙或50～70kg石灰;叶片灰绿，叶脉间黄化，下部叶片脱落,植株矮小，坐果率低,可施l％～3％的硫酸镁或l％的硝酸镁，每667㎡喷施肥液50kg左右；缺硼，花粉发育不良，坐果率低。可施0．1％～0．25％的硼砂或硼酸溶液，每667㎡喷40～80kg，每6～7天1次。要连喷2—3次。
4、补施气肥
施用二氧化碳可提高坐果率。棚栽辣椒早春可从初花期开始施用二氧化碳气肥，连续用15天，浓度以晴天750mg／kg、阴天550mg／kg为好。
