一、莲藕褐斑病。荷叶部常见的一种病害，叶上产生淡褐色病斑，引起病叶局部干枯。防治：合理密植，确保藕田通风透光；适当增施磷钾肥，提高植株抗性，及时清除病株残体。发病初期用25％多菌灵600倍液，或75％百菌清1000倍液喷雾。
二、莲藕黑斑病。又称褐纹病，仅发生在叶片上，严重时病斑汇合，叶片枯黄。防治：冬季田间彻底清除病残叶并集中烧毁。发病初期摘除病叶，并喷药防治。常用70％甲基托布津1000倍液，或65％代森锌600倍液，或1：1：160－200倍波尔多液，每隔10－15天喷1次，共喷2－3次。
三、莲藕腐败病。又称枯萎病，侵染地下茎造成腐烂，严重时全田一片枯黄，似火烧状。防治：重病田实行2－3年轮作。常用70％甲基托布津1000倍液或75％百菌清800倍液喷雾闷种，盖农膜密闭24小时，晾干后种植。深翻藕田并亩施150公斤石灰。发病时可用75％百菌清0．5公斤加干泥土30公斤拌匀撒入浅水田内。
四、莲藕条斑病毒病。受害后的荷叶及地下根茎上均可表现症状，叶片上产生大型多角形至不整齐形淡褐色枯斑，根茎表皮产生暗褐色炭疽条斑。防治：选用抗病品种，及时防治蚜虫（传毒媒介），发病初期喷1．5％农业知识植病灵乳剂1000倍液。
五、荷叶枯萎病。受害荷叶焦黄、枯萎，影响莲藕生长，造成减产。防治：保持藕田清洁，防止油污污染藕田。污水、肥皂水也会导致荷叶枯萎死亡。莲藕对除草剂十分敏感，藕田决不能施用除草剂。
六、常见病虫。有蚜虫、大蓑蛾、梨青刺蛾、褐刺蛾，危害立叶和花蕾。可用90％敌百虫800－1000倍液，或40％乐果2000倍液喷洒。水蛆吮吸莲藕根、茎
