枸杞树经过一年的生长，枝杈繁多，树冠凌乱，而且在新果枝形成的同时，一部分结果枝开始衰老。因此，枸杞在冬季要进行修剪，否则，将影响翌年的产量和品质。通过修剪，去旧换新，选留结果力强的老眼枝和七寸枝，剪除非生产性的枝条，可为下一年老眼枝结果和生长新的结果枝打下良好的基础。
冬季修围，主要是对树冠结果枝层的修剪。选留良好的结果枝，剪除结果枝层的老枝、针刺枝、病虫枝、风折枝、交叉枝、重叠枝和密挤枝。修剪时依据新果枝的数量，决定老枝的取舍。新枝多，老枝可以回缩至健壮分枝处。在修剪口涂抹愈伤防腐膜保护修剪口组织愈合。
冬季修剪，宜轻不宜重，不要短截太多。因为枝条顶端16.5厘米左右是第二年结果最早的芽眼，结果枝短截太多，直接影响明年春果的产量。为做到不漏剪，应从上到下，围绕树冠顺一方向精细修剪。
