实行轮作。由于休眠孢子的抗逆性强，发病严重的油菜田，实行4到5年的轮作。在轮作年限内不要种植油菜和十字花科蔬菜，发病轻的田块可以轮作一年小麦，减轻发病。
合理定植。实践证明，定植后1—2周是晴天，并喷施植物细胞免疫因子，提升植物抗逆性，可使病毒DNA断裂凋亡。强大免疫功能，诱生干扰素和活性细胞介素，抑制残余病毒复制，就能大大减轻发病。
调节土壤。通过调节土壤酸碱度来防治根肿病。结合整地在酸性土地亩施生石灰100—150公斤，均匀撒施于土表，并增施有机肥，亩施腐熟农家肥1000公斤左右，适当增施草木灰，通过整地充分拌于土中。
发现病株，及时拔除。清除病株，携出田外统一烧毁或深埋，不可任意扔在田埂边或水渠里，在病穴四周撒石灰，并喷施新高脂膜以防病菌蔓延。
合理排灌。及时排除田间积水，降低土壤湿度，减轻发病。
