在上万种中药材中，本草类的药材占了大部分，作为自然植物，它们绝大部分在采收之后需要马上加工，以储存更长时间。根据这些本草类中药材取材部分不同，分别有不同的加工方法。
全草类：采收后在通风处阴干或晾干，尤其是含芳香挥发油类成分的药材，如薄荷、荆芥、藿香忌晒，以免有效成分损失；有些全草类药材未干透前就应扎成小捆晾至全干，如紫苏、薄荷、断血流等。一些含水量较高的肉质
叶类：如马齿苋、垂盆草应用沸水略烫再进行干燥。
花类：采后在通风处摊开阴干或在低温下迅速烘干，以免有效成分散失，保持浓郁香气，如红花、芫花、金银花、玫瑰花、月季花。
果类：果实类药材采收后晒干或烘干即可，但果实大又不易干透的药材，如佛手、酸橙、宣木瓜应切开干燥；以果肉或果皮入药的药材，如桥楼、陈皮、山茱萸等，应先除瓤、核或剥皮后干燥。
种子类：果实采收后晒干、脱粒、收集种子。有些药材须去种皮和果皮，如蕙苡、决明子等。有的要击碎果核取出种仁，如杏仁、酸枣仁等。有的要蒸，以破坏药材易变质变色的酵素，如五味子、女贞子等。
根茎类：洗净泥土，除去须根、芦头和残叶，大小分级，趁鲜切片、块或段，晒干或烘干，如白芷、丹参、牛膝等；一些肉质性、含水量较高的块根及鳞茎类药材，如天冬、百部应用沸水稍烫，切片晒干或烘干；对于粗大根
茎类药材：如玄参、莴根应趁鲜切片再进行干燥；对于燥后难去皮的药材，如丹皮、桔梗应趁鲜刮去栓皮；对含淀粉、浆汁足的药材，如天麻、地黄、玉竹、黄精、何首乌应趁鲜蒸制，切片晒干。有些种类如北沙参、明党参先用沸水略烫，再刮皮、洗净、干燥；如丹参、玄参、白芍要经沸水煮，再反复发汗才能完全干燥。
皮类：采后趁鲜切成片或块晒干即成。有些种类采收后应趁鲜刮去外层栓皮再干燥，如丹皮、椿柏皮等；有的树皮类药材采后用沸水略烫，加码叠放使其发汗，待内皮层变成紫褐色时蒸软刮去栓皮，切成丝、片或卷成筒进行干燥，如肉桂、厚朴、杜仲等。
当然，有些加工方法是不可取的，比如采用硫熏，虽然有很好的防虫效果，但残留的硫磺会给服用者的健康带来巨大的危害，使草药变成毒药。