苹果疫腐病主要为害果实、根颈及叶片。果实受害后果面产生不规则形，深浅不匀的暗红色病斑，边缘不清晰似水渍状。有时病斑部分与果肉分离，表面呈白腊状。果肉变褐腐烂后，果形不变呈皮球状，有弹性。病果极易脱落，最后失水干缩成僵果。
果实疫腐病的防治
（1）疫腐菌在病残体的土壤中越冬，所以清除病残体，及时清理落地果实并摘除树上病果、病叶集中深埋，是一项重要的防病措施。
（2）由于疫腐病菌是以雨水飞溅为主要传播方式，所以果实越靠近地面越易受侵染而发病，以距地60厘米以下的果实发病最多，一般最高不超过1.5米，适当采取提高结果部位和地面铺草等方法，可避免侵染减轻为害。
（3）改善果园生态环境，排除积水，降低湿度，树冠通风透光可有力地控制病害。
根颈部疫腐病的防治
应采取预防为主和手术治疗相结合的方法。
根颈部发病还未环割的植株，可在春季扒土晾晒，刮去腐烂变色部分，并用福美锌或石硫合剂消毒伤口，刮下的病组织烧毁，更换无病新土，复土高度应略高于地面呈倒锅形。另外防止串灌水，排水系统健全，翻耕和除草时注意不要碰伤根颈部。必要时进行矫接，可促使提早恢复树势，增强树林的抗病性。
