一、查苗补子，查苗补苗。要达到既定株距95%以上的密度，保全苗是苗期最主要的工作。先是查苗补子，在第一片真叶平展后即移栽补苗。一是就近移栽，二是移栽备用苗。
二、早间苗、早定苗。大田直播一般在2片真叶即定苗，苗床一片真叶展开即定苗，新疆大田直播在子叶平展后既定苗。黄河流域套作棉田先间苗，一般定苗推迟到3-4片真叶。
三、早中耕除草灭茬。地膜覆盖棉田中耕机械作业的走到。直播不盖膜棉田要勤耕，勤锄地，既除草又增温，中耕宜由浅到深，由远到近。
四、适时浇水。苗期浇水主要是指麦田套播的棉花。干旱年景一般在共生期浇水3―4次，其他棉区在灌足底墒水基础上，苗期一般不浇水。
五、防治病虫害。苗期病害多，可用波尔多液、多菌灵等药剂防治。苗期有地老虎蓟马等，地老虎用毒饵防治，蓟马用久效磷防治等等。
