(1)水稻各生育期的耐涝性
根据中国科学院植物生理研究所的试验研究结果表明：苗期淹水2～6天，排除水后数天即能恢复生长，只有部分叶片干枯；淹水8～10天，叶片均干枯，但出水后秧苗还可恢复生长。分蘖期淹水2～4天，排水后尚能逐渐恢复生长；淹水6～10天，地上部分全部干枯，但分蘖芽和茎的生长点尚未死亡，故排水后尚能发生新叶和分蘖，但淹水时间愈长，生长愈慢。幼穗分化期淹水10天，颖花分化受抑制，幼穗不能抽出，以后发生高节位分枝，能抽穗，但不结实(主要是抽穗太迟的缘故)。孕穗期淹水，抑制了幼穗发育，形成畸形穗、颖花退化(白稃)等现象，淹水6天以上，大部分都不能抽穗，以后形成的高节位分枝，部分抽穗而不结实。抽穗开花期淹水2～4天，出水后稻穗下部小花尚能开花，部分可结实；淹水6天以上，因花粉、花药破坏，虽能开花而不能授粉，不久穗子即干枯。乳熟期受淹，影响谷粒灌浆，千粒重减低，米质变劣。
据华南农业大学在水稻遭受特大洪灾后调查，连作晚稻秧苗受淹后，以老秧龄耐涝性较强，其次为未出苗的芽谷。连作早稻孕穗期淹水7天，幼穗腐烂，完全无收；开花期淹水7天，不实率高达95%；乳熟期淹水7天，不实粒和腐烂粒占40%；蜡熟期淹水7天，受害较轻，尚可有7成、8成收获。
(2)淹水时间长短对水稻的影响
水稻受淹后，淹水的时间越长，损害的程度越大，减产越重。其产量损失主要表现在茎叶遭受破坏，幼穗死亡增加，幼穗颖花和枝梗退化增多，结实率降低，千粒重下降。这是由于水稻受淹后，正常的呼吸作用和同化作用受阻，生理机能遭到破坏所致。
(3)淹水深浅对水稻的影响
水稻在淹水天数相同的情况下，淹水越深，受害越重。据浙江嘉兴地区农科所的调查，单季晚稻如以基本不受淹(最高水位在胎肚以下)每公顷4125公斤为100%；则淹没半肚4天，每公顷3750公斤，减产9.1%；没肚4天，每公顷2775公斤，减产32.7%；没顶4天，每公顷2100公斤，减产41.9%。
(4)水温的高低对水稻的影响
淹水的温度愈高，对水稻的危害也愈大。淹水温度在25°C以下淹没4天，对生育和结实危害较小；如果水温在30°C以上淹没4天，危害就大，不易恢复，结实也不正常；温度若达40°C淹没4天，则受害严重，稻株枯死，颗粒无收。
(5)淹水的水质和流速快慢对水稻的影响
发生洪涝害后，水的流速快，水质浑浊，常夹带大量泥沙，对水稻机械损伤较大，造成稻株压沙死亡或茎叶、稻穗粘泥，影响光合作用和开花结实，损失较重。稻田受涝后，水质较清，流速较慢，对稻株机械损伤较小。
