1．温度检查。入冬以后，水分在11%以下，每隔5～10天检查1次，12%以上则应每天检查。温度检查应在不同方位、不同层次定时多点进行。
2．通风检查。当外界温、湿度均低于仓内时，应及时通风，此时通风既可降温又可排湿；当仓外温度与仓内温度相同，而仓外湿度低于仓内或仓内外湿度基本相同，或仓外温度低于仓内时，也可以通风，前者以散湿为主，后者以降温为主。
3．种子质量检测。贮藏期间要定期检查棉花种子质量，以便安全贮藏。一般进行发芽率、水分、健子率的测定，发现问题应及时解决，如加强通风、晾晒、倒仓等。
4．防火。棉籽有短绒，本身含油量又高，遇到火种就容易引起燃烧。所以要严禁火种接近棉花种子仓，仓库周围也不要堆放易燃、易腐品。工作人员进仓离开时要及时关闭电源。
