一、在使用种子、苗木时应检查是否带有线虫，千万不要人为传播。由于种苗移栽、大水漫灌、农事操作是根结线虫传播的重要途径，在温室中安装滴灌设备，在温室门口放置消毒液，进入温室前消毒鞋底或换鞋。
二、高温闷棚、低温冷冻、轮作倒茬是防治线虫的有效方法。
三、低温冷冻法是使作物休闲期调整到最寒冷的季节，可有效控制根结线虫病，适宜在冬季温度低于-15℃持续20天以上的地区推广应用。轮作可经切断食物链，使根结线虫饥饿死亡。
四、根结线虫虽然寄主范围很广，但感病、抗病性有明显差异。重发病田与葱、蒜、韭菜等轮作、套作；有条件的地区采用水旱轮作。
五、在黄瓜播种或移植前15天，每公顷用0.2%高渗阿维菌素可湿性粉剂60-75千克或10%噻唑膦(福气多)颗粒剂30千克，加细土750千克混匀撒到地表，深翻25厘米，进行土壤处理。
六、在发病初期可用1.8%阿维菌素乳油1000-1200倍液、或50%辛硫磷乳油1000-1500倍液等药剂灌根。每株灌药液250-500毫升，每隔7-10天灌1次，灌2-3次。