一、番茄种植地实行与十字花科作物或禾本科作物2-3年以上的轮作。设无病留种田或从无病单株采种。
二、番茄种子在播种前，用55℃温水中浸泡15分钟，然后转入冷水里冷却，晾干后再播种。或者用1∶10农用链霉素浸种30分钟。
三、番茄适时整枝打杈，及时清除病残体。雨季加强排水，降低田间湿度，保持田间通风透光。施足氮、磷、钾肥，增施菌肥、腐熟的优质有机肥，以活化土壤，增强植株的抗病能力。
四、在番茄疮痂病发病初期，及时喷施药剂防治，药剂可用：47%加瑞农可湿性粉剂600倍液、或72%的农用链霉素2000倍液、或77%氢氧化铜可湿性粉剂400-500倍液、或硫酸链霉素可溶粉剂4000-5000倍液、或2%春雷霉素液剂3-4克/公顷进行防治，每隔7-10天喷1次，连喷2-3次。
