一、病害
1、危害特点。棉苗从子叶期到1-2片真叶期最易感染各类病害。危害棉苗根部的病害有立枯病、炭疽病、红腐病；而黑斑病、轮纹斑病、角斑病、疫病、褐斑病等危害叶部；茎枯病危害幼茎及生长点。这些病害在夏季多雨、阴湿、低温时最易发生，且往往是混合并发，成灾较多。轻的引起僵苗迟发，重的导致烂芽、烂根，叶枯茎腐，缺苗断垄，乃至成片死亡。对产量和品质影响很大。
2、防治方法。应加强田间管理，棉花出苗后要深中耕、勤中耕，以提高土温，降低土壤湿度，使土壤通气，以利根系发育。对于出现病苗、死苗应及时清除出田，集中处理，以减少田间病菌数量及传染机会。加强肥水管理。苗期追肥要合理，掌握“少吃多餐”的施肥原则，第1次苗肥应在齐苗前后3-5天施用。在追施无机氮时，要配合施用草木灰等钾肥，以利于棉苗健壮，阴雨天时，注意防水排渍。齐苗后每隔10天淋洒1遍20%稻脚青600-800倍液，能很好地防治根病。波尔多液按1:1:200比例配合喷施，能很好地防治各种叶病，防治叶病还可用50%多菌灵或托布津800-1000倍液喷施。
二、虫害
1、危害特点。从播种到现蕾前，危害种子和幼苗根部的有种蝇、金针虫、蛴螬等。地老虎和蜗牛咬断嫩茎和咬食叶片，刺吸汁液的有棉蚜、棉蓟马、棉叶螨等。棉苗受这些虫危害后，导致棉苗植株矮小，叶片变小，失绿变红有斑点、有缺点、有的缺整片叶。地老虎能够咬断棉茎，造成棉花缺苗断垄，发生棉叶螨后，棉苗呈火烧状；发生棉蚜后，棉株形成“龙头”叶片卷缩，导致根系发育不良，生长停滞，并推迟现蕾。
2、防治方法。防治地老虎等地下害虫，最好用青草拌药，喂杀，即用2.5%敌百虫粉0.5千克，拌鲜草50千克，每亩用15-20千克，于傍晚撒在棉苗旁边，每隔一定距离撒一小堆，第2天早晨到棉苗旁捡虫子；防治棉蚜可用50%抗蚜威可湿性粉剂每亩50-70克，1000-1200倍液喷施到棉叶及茎上；防治棉蓟马可用3.5%甲敌粉每亩2千克喷粉；防治棉叶螨可用73%克螨特1000-1500倍液喷施。注意一定要喷在叶背上，防治效果才好。
