1、猝倒病、立枯病在育苗期较常见，易造成大量死苗。预防的方法：用72%普立克水剂400倍液或64%杀毒矾可湿性粉剂600倍液喷洒。
2、疫病全生育期都可发病，特别是雨后较重，发病后常引起大量的落叶、落花、落果。防治方法：72.2%普立克水剂400倍液、64%杀毒矾600倍液或75%百菌清可湿性粉剂600倍液，叶面喷洒，以上药剂交替使用7～10天一次进行预防和治疗。
3、病毒病它是辣椒栽培中为害最普遍，损失最严重，防治难度最大的病害。该病只有预防，一旦发病，很难根治，减产严重，重者绝收。预防方法：首先要消灭传播此病毒的害虫（如蚜虫），可用20%吡虫啉1000倍或50%抗蚜威1000倍等防治。其次要避免人为传播，如整枝打杈等农事操作。最后还要加强肥水管理提高植株抗病能力，主要是通过培育壮株、喷施硫酸锌叶面肥等措施促进植株生长。
4、炭疽病主要危害症状：辣椒果实引起腐烂，老果易发病，形成白皮壳、黄皮壳，导致品质降低。预防药剂有：75%百菌清600倍、70%甲托1000倍、20%炭疽神美300倍液连续喷洒3次以上有较好效果。
