小麦穗发芽是指收获前遇到阴雨天气时籽粒在穗上发芽的现象，我省淮南冬春麦区常见气象灾害。影响小麦贮存及下季或翌年播种质量，对小麦生产造成较大经济损失。小麦穗发芽主要是天气原因与品种特性共同作用的结果。小麦收获前遇连阴雨天气是诱发穗芽发生的主要外部因素，而内因则是小麦本身的生殖休眠特性。麦穗发芽会导致小麦种子内部一系列的生理变化，蛋白质、淀粉等贮藏物质分解，从而造成籽粒产量、面粉的营养品质和加工品质下降，直至丧失食用、加工价值，同时，小麦失去种用价值，影响小麦贮存及下季或翌年播种质量，对小麦生产造成较大经济损失。
麦熟期与雨季吻合遇到连阴雨天气，经常遇有连阴雨或潮湿天气，造成穗发芽。其原因一是小麦成熟时的环境条件影响；二是受穗部形态如颖壳形态、穗的大小、疏密程度、芒的长短等遗传因素影响。①休眠期短的品种易穗发芽。②小麦种子籽粒胚乳对刺激麦粒合成α淀粉酶活性的GA#3反应敏感的品种易穗发芽。③凡小麦颖壳中含有发芽抑制物少的品种易发芽，反这则抗穗发芽。④麦穗籽粒吸水速率受麦穗结构影响，吸水快的品种，穗发芽严重。℃茎秆坚韧，穗子稀疏，无毛等有助于抗穗发芽，此外，小花开放状态、穗子蜡质程度、芒长、粒色、颖片坚韧度、穗子密度对穗发芽具有修饰作用。综上所述籽粒低的α淀粉酶活性、小的籽粒吸水速率、低的GA#3含量及颖壳中的发芽抑制物是小麦抗生理发芽性的主要机理。种子休眠性仅是影响发芽因素之一，最终受内部生理生化特性制约。籽粒的吸水特性及α淀粉酶活性直接影响穗发芽性。品种的开态结构对穗发芽抗性起修饰作用。
防治方法：1、选用抗穗发芽品种。一般来说，红皮小麦品种比白皮小麦品种种子休眠时间长，比较抗穗发芽。建议根据当地气候、生态特点选用高产优质红皮小麦品种扬麦16、宁麦13等。
2、适期迟播或早播，及时收获。根据当地梅雨季节到来时间，适当早播，尽量赶在连阴雨天气到来前收获。或者适期迟播，连阴雨天气到来时，小麦成熟度低，减少小麦种子穗发芽的发生。
3、合理肥水调控。防止肥料施用过迟过多，造成贪青迟熟。
4、降渍除涝。在栽培管理上，凡一切降渍防倒的措施均有利于减少田间穗发芽的发生。建好田间配套沟系，确保灌排畅通，以降低田间湿度，减少穗发芽发生条件。
5、应用化学调控制剂。在目前白皮小麦抗穗发芽能力普遍偏弱的情况下，采用化学防治也是防止穗发芽的一种较为简便而有效的手段。应用较多多效唑和穗萌抑制剂，在小麦花后一定时期内喷施，可以控制穗发芽。
