在不同的苗期，番茄有不同的施肥方法。
1、苗期底肥：在11平方米的苗床上施入腐熟的混合粪100-150千克，掺入过磷酸钙1千克，氯化钾0.3千克，充分混匀。可以培育壮苗，促使花芽形成早，发育快。
2、苗期追肥：结合浇水，施入腐熟稀粪或者是0.1%-0.2%的尿素(根据苗情，也可不追施)。
3、重施基肥：按照每亩5000千克产量，施入优质有机肥5000-7000千克，过磷酸钙25-50千克，钾肥10千克。
4、催苗肥：地力不足时，在浇缓苗水时，每亩追施稀粪水500千克或者追施铵态氮肥10千克。底肥足时，可以不追此遍肥。
5、催果肥：第一果穗膨大时，随水施500-1000千克稀粪或化肥15-20千克。本次追肥要及时，防止果实营养不良。
6、盛果肥：第二、三穗果迅速膨大时，追肥2-3次，每亩每次施氮肥13-20千克，第一次追肥时可以施过磷酸钙10-15千克。满足迅速增长需肥，防止早衰，促进果实饱满。
7、盛果后期肥：可以结合打药，叶面喷施0.3%-0.5%磷酸二氢钾，防止早衰，提高果实品质和产量。
