大豆一生中根腐病是主要病害之一。其症状主要受害部位为主根，病斑初为褐色至黑色或红褐色小斑点，以后迅速扩大呈菱形、长条形、不规则形大斑。逐渐整个主根变为红褐色，溃疡状，皮层腐烂，侧根和须根脱落。主根变成秃根。病株地上部长势很弱。叶片黄而瘦小，植株矮化，少分枝或不分枝。重者死亡。轻者虽可继续生长，但根系减少，长势弱，叶片变黄，提早脱落，结荚少，籽粒小，产量低。
主要防治措施有以下几点：
1、选用抗病品种，首先要选用无病种子田留种，同时要选抗病、优质的大豆品种。
2、合理轮作，与禾本科作物三年以上轮作，严禁大豆重迎茬，合理混作。
3、垄作栽培，垄作有利于降湿、增温，减轻病情。
4、适时晚播晚播出苗快，发病轻，播深不能超过5厘米。
5、排水雨后及时排除田间积水，降低土壤湿度，减轻病情。及时进行中耕培土，促进地上茎基部侧生新根的形成。
6、施肥施足基肥、种肥，及时追肥，尤其应用多元复合液肥进行叶面施肥，弥补根部受害吸收肥水的不足。
7、化学防治在根腐病发病初期，每亩用40-50克复活一号加上10克生根粉药水，制成30-45千克的药液喷雾，也可用恶霉灵加生根粉，用量用法同上。发病严重时，隔7-10天再喷一次。应用含有多菌灵、福美双和杀虫剂的大豆种衣剂包衣，用种子重量的1.0%-1.5%药剂进行拌种，可以防治根腐病和潜根蝇。进行种子包衣时，加入大豆专用肥，同时施用，效果更好。种子包以剂可以选用40%卫福种衣剂、35.6%阿维菌素-多菌灵-福美双种衣剂、18%福克种衣剂等包衣处理，防效超过80%。
8、生物制剂拌种大豆根保菌剂按每公顷用重量，1500毫升液剂拌种。菌克毒克（宁南霉素）：每100千克种子，用2%菌克毒克水剂1000-1500毫升拌种。用埃姆泌每公顷45-75千克或大豆根菌颗粒每公顷30千克，与种肥混播。
