一、定植至坐果期，遇低温连雨天，发生猝倒病、根腐病、细菌性角斑病、细菌性果腐病、枯萎病、蔓枯病引发的根部、蔓部和叶部病害，造成甜瓜苗期、伸蔓期死秧。使用大量使用除草剂的玉米产区，甜瓜定植后遇第一次大雨，还会发生除草剂药害，造成大量叶片枯死。
预防办法：做好种子消毒和苗期病害防治，种子用50%多菌灵500倍液或50%甲基托布津800倍液浸种1小时杀灭菌真菌性病菌，然后将种子洗净，再用72%农用硫酸链霉素1000mg/kg浸种30分钟，杀灭菌细菌性病菌，用清水浸泡5～6小时，洗净后摧芽播种。播种前或播种后用95%恶霉灵兑水3000倍均匀喷洒于苗床内预防立枯病、、根腐病等苗期病害。遇低温阴雨天气，发生猝倒病，在发病初期喷淋适乐时1500倍液灌根或用恶霉灵（绿享1号）进行叶片喷雾。在移栽前2—3天或栽后1－2天用适乐时1500倍液灌根或喷雾。定植后遇低温阴雨天，用链霉素防细菌性果腐病等细菌性病害。用霉多克、金雷多米尔-锰锌防治霜霉、疫病等真菌性病害。整枝打杈应配合喷洒农用链霉素、霉多克等农药防止伤口感染。常发生除草剂药害或低温年份，为了加快瓜苗的生长，应喷200倍液钾宝或0.2%尿素加0.2%磷酸二氢钾或1000倍液植物动力2003或宝力丰、鱼蛋白等喷洒补充营养。
二、枯萎病、蔓枯病引发的根部、蔓部病害，主要表现为坐瓜后果实成熟前根部或蔓部发病，植株枯萎。
预防办法：1、选用顺天糖妃、顺甜一号、绿肉皇后等高抗根部病的品种，基本不死秧，枯萎病、蔓枯病高发区露栽培，最好不选红瓤黄白皮品种。2、重茬栽培，用专用南瓜砧木或抗病甜瓜砧木嫁接。3、在移栽瓜苗前10－15天重新开沟，用多菌灵或甲基托布津对沟内进行喷布；定植时用恶霉灵或适乐时灌根，有些地区重茬栽培还会发生根结线虫，可在定植时施用克线磷颗粒剂等防治。发病后用95%恶霉灵4000倍液或适乐时1500倍液灌根防治枯萎病，蔓枯病用世高防治。
三、甜瓜伸蔓期至结果期遇低温阴雨天气或果实接近成熟期遇连雨天或雨后下雾，甜瓜叶片上出现小黄点，几天内病斑扩大变成黑灰大病斑，一周之内大量叶片枯死，满地瓜球失去商品价值。主要是霜霉病或有时并发细菌性叶斑病、细菌性角斑病、细菌性果腐病、果腐病、疫病、炭疽病、叶枯病。其中霜霉病是目前露地地膜甜瓜最难防治的病害。
防治方法：露地薄皮甜瓜霜霉病菌主要由大棚黄瓜传染到露地黄瓜，再传到甜瓜，雨后雾后发病，一周内可造成大量叶片枯死，仅蔓尖部保留少量新叶无病。1、采用双膜全程防雨栽培，雨天及时将棚膜盖好，降低空气湿度，是目前防治甜瓜病害最有效办法。2、选用顺天糖妃、顺甜一号、顺甜时代、航天时代、顺甜一号、绿肉皇后等抗病品种也可减轻病害。3、果实膨大期至果实成熟期遇连雨天，喷烯酰吗啉、霉多克、霜脲锰锌、安克-锰锌、克露、领跑、金雷多米尔-锰锌、腈菌唑等防病。交替用药，7天1次，做到雨后抢阴、晴天及时施药，可同时防甜瓜霜霉病、果腐病、疫病、炭疽病、叶枯病等多种叶病。花期、坐果期最好用不含锰的霉多克，烯酰吗啉。一定要提前买好真药，多数农民发病后才在当地买药，常买到假药、劣药，根本防不住，只要选用抗病品种，用真药，及时防病，除极特殊多雨年份，一般都能防住，但成本也很高。用腈菌唑、特富灵、武夷霉素、福星、仙生等防白粉病，如40%福星乳油6000～8000倍，10%世高水分散性颗粒剂2000～3000倍，20%福晴可湿性粉剂1000～1200倍，25%晴菌唑乳油5000～6000倍，62%仙生可湿性粉剂800倍液等交替用药，7天1次。大面积种甜瓜的村屯最好不种黄瓜，种甜瓜的农民家最好不种黄瓜，去甜瓜地前不要去黄瓜地。
四、近几年甜瓜裂瓜、烂瓜现象特重,土壤中缺硼、缺钙或嫁接栽培时，由于砧木对钙的吸收能力差，容易引起钙往果实内移动失调；多氮，多氮农业知识、多钾的土壤中，高温干旱都会使钙的吸收会受到阻碍，产生裂果，发酵果；发生细菌性果腐病、细菌性角斑病是近年甜瓜裂果烂瓜的主要因素。
防治方法：1、选用航天糖妃、顺甜时代、航天时代等抗裂瓜烂瓜品种，并保持植株有一定的长势。2、注意浇水时期和浇水量。种植甜瓜的土壤不可忽干忽湿，坐瓜及时浇水。3、坐果期整枝不可太很，以防幼果开裂，坐果后轻整枝，让叶片盖住瓜，减少阳光直射果实。4、亩施硼砂、EM菌肥和以色列产宝力丰微肥，喷硼酸，氨基酸钙、氯化钙可减少因缺钙、缺硼造成的裂果，发酵果。5、高效坐瓜灵浓度不可过高，不可重喷，含唑类杀菌剂药量不可过大，以防引发裂瓜。6、种子用链霉素消毒，从苗期开始使用72%农用硫酸链霉素防治果腐病等细菌性病害，7天喷洒一次，可防细菌性果腐病、细菌性角斑病诱发的裂果烂瓜，细菌性果腐病一定要早防，发病后很难防治。如果购不到农用链霉素，也可用医用链霉素代替，方法是用10万单位1支的医用链素5支加入50kg水中喷施。
