大家都知道绿色食品是指无污染的安全、优质、营养类食品，其生产过程受到全程控制，在病虫害防治上多采用农业防治、生物防治等措施进行控制，但当病虫害发生较重时，也要使用一些生产绿色食品允许使用的农药进行防治。
绿色食品生产中农药使用方法与常规生产农药使用方法基本一致，主要有喷雾法、喷粉法、撒粒法、熏蒸法、浸种（苗）和拌种法、土壤处理法、植物药剂注射法和包扎法等。
一、喷雾法：喷雾法是农药使用方法中常用的一种，也是广大农民经常使用的。这种方法是将可兑水使用的农药剂型按照一定的比例兑水后进行喷雾或用其它制剂直接进行超低容量喷雾。根据每亩面积上喷雾的液体量又可分为常量喷雾（每亩用液体40升以上）、低容量喷雾（每亩用液体量1---10升）和超低容量喷雾（每亩用液体量低于0.33升）三种。喷雾效果的好坏受到作物的高矮、株冠形状、茂密程度、农药种类以及天气状况的影响。
二、喷粉法：是利用鼓风机械所产生的气流把农药粉剂吹散后沉积到作物上的施药方法，由于这种方法在施药过程中存在药粉飘移问题，因此局限在温室、大棚、森林、大型果园、大面积水稻田中应用。按照施药手段可分为：手动喷粉、机动喷粉、飞机喷粉三种。
三、撒粒法：撒粒法是最简单、最方便的农药施用方法，目前各地大多采用手施法即用手直接抓着农药颗粒撒施。由于颗粒剂农药粒大，下落速度快，受风的影响小，适合土壤处理，水田施药和多种作物的心叶施药。
四、熏蒸法：是利用熏蒸常温密闭的场所产生毒气或气化来防治病虫害的方法。主要应用于粮库等密闭场所。
五、浸种（苗）和拌种法：拌种是将药剂与种子均匀混和，从而杀死种子上的病菌、害虫；浸种（苗）是将种子或幼苗浸在一定浓度的药液里，使种、苗黏着并吸收一定量的药剂，从而达到杀死种子、幼苗上的病虫害的目的。（1）拌种法是用干药粉直接拌种或用旋转容器旋转拌种。（2）浸种法是把种子或幼苗先在清水中预浸，沥干水后再浸入配好的药水中，浸一定的时间后取出晾干即可。
六、土壤处理法：土壤处理法是将农药采取喷雾、喷粉、撒毒土直接施在地面或一定土层内，防治病、虫、草害的方法。具体有三种方法：（1）将农药直接喷洒在地面，然后翻耕；（2）是将农药与土混合后撒在地面；（3）是将农药兑水后浇灌在植物根部。
七、植株药剂注射法和包扎法：采取强制办法把内吸药剂通过植物的主要运输渠道---导管系统，送到树干内，从而达到防治病虫害的目的。包扎法是把药剂包在树干外，药剂通过皮孔进入导管系统；注射法是把药剂直接注入树干。注射法比包扎法更易显效。
总之，绿色食品生产中农药使用方法多种多样，但最根本的是所使用的农药必须符合生产绿色食品的要求。如：生产A级绿色食品允许使用的中等毒性以下的植物源农药、动物源农药、微生物源农药；矿物源农药中的硫制剂、铜制剂；《绿色食品农药使用准则》中规定可以有限度地使用的部分有机合成农药。坚决不用准则中不允许使用的农药品种。
