辣椒霜霉病主要伤害叶片、叶柄及嫩茎。叶片染病时，刚开始出现浅绿色不规则形病斑，叶背面有稀疏的白色霜霉层，病叶变脆并向上卷，后期叶片易脱落。叶柄、嫩茎染病，呈褐色水渍状，病部也出现白色稀疏的霉层。
防治方法主要有：
第一，选用抗耐病品种，实施2年以上轮作。收获后彻底清除田间病残体，集中深埋或烧毁，并及时深翻。
第二，通过调控棚室内温湿度，缩短结露持续时间可控制辣椒霜霉病发生。十一月到第二年的二月保护地温度10度到25度，湿度在75％到90％时容易发生辣椒霜霉病，一般采用通风散湿提高棚室温度防止发病，当晴天上午温度升到28度到30度时，进行放风，温度控制在22度到25度，可降低湿度，当温度降至20度时，要马上关闭通风口，保持夜温不低于15℃，可以大大减少结露量和结露持续时间，就可减轻辣椒霜霉病发病率。
第三，田间发病后及时进行防治，在发病初期田间出现发病中心时，可采用以下杀菌剂或配方进行防治：50％锰锌·氟吗啉可湿性粉剂2000倍液；68％精甲霜·锰锌水分散粒剂800到1000倍液；60％唑醚·代森联水分散粒剂2000倍液；25％吡唑醚菌酯乳油3000到4000倍液＋70％代森联干悬浮剂500倍液；53％甲霜·锰锌水分散粒剂600到800倍液；20％苯霜灵乳油300倍液＋75％百菌清可湿性粉剂600到1000倍液；72％霜脲·锰锌可湿性粉剂800倍液；72.2％霜霉威水剂800倍液＋70％代森锰锌可湿性粉剂600到1000倍液；25.75％多抗·福美双可湿性粉剂1000到1500倍液；60％琥·铝·甲霜灵可湿性粉剂600到800倍液；75％百·福·福锌可湿性粉剂800到1000倍液；对水喷雾，视病情隔5到7天喷1次；发病普遍时，可采用下列杀菌剂或配方进行防治：50％烯酸吗啉可湿性粉剂2000倍液＋70％代森联干悬浮剂500倍液；687.5g/L氟菌·霜霉威悬浮剂1000倍液＋70％代森锰锌可湿性粉剂600倍液；25％甲霜·霜霉威可湿性粉剂700倍液＋75％百菌清可湿性粉剂500倍液；100g/L氰霜唑悬浮剂1000倍液＋50％克菌丹可湿性粉剂800倍液；72％霜脲·锰锌可湿性粉剂500倍液；70％丙森锌可湿性粉剂500倍液；60％唑醚·代森联水分散粒剂1000到2000倍液；84.51％霜霉威·乙麟酸盐可溶性水剂600到1000倍液；70％呋酰·锰锌可湿性粉剂600到1000倍液；雨季，在下雨前进行茎叶喷雾防治（重点喷果），根据病情隔7到10天喷1次。
第四，保护地栽培时还可以使用45％百菌清烟雾剂250g/亩或20％百·福烟剂250到300g/亩或20％锰锌·霜脲烟剂250到300g/亩。傍晚封闭棚室，将药分放于5到7个燃放点，烟熏过夜或喷撒5％百菌清粉剂lkg/亩。间隔7到10天用1次药，最好与喷雾防治交替进行。
