冬季莲藕留种是非常关键的，也是非常重要的，冬季莲藕留种是离不开水的，防止土壤干燥，使种藕受冻。要获得高产、优质的莲藕或莲子，必须做到以下几点：
一、在不能经常保持浅水处，要用稻草覆盖防寒，第二年栽藕前挖出种藕，随挖随栽。每亩留种田可供5～6亩地用种。
二、连作藕田在采藕时，用采八留二的方法留种，即每采2米宽留0.5米宽不采，作为下年的种藕。以后各年轮换采收和留种部位。
三、种藕采收时要谨慎小心，保持藕身完整，不要损伤、碰断芽头。种藕收获后，到栽植时还应再选择一次。根据品种特征，选藕身端正、肥大、完整，先端有子藕，无病虫害、无伤痕的留作种藕。
我国莲藕的种质资源丰富，近年来选育成的品种有科选1号、鄂莲1号、浙湖1号、武植2号、赣莲85-4、赣莲85-5等。
