由于近几年的蔬菜栽培时间较长，未来追求经济效益，有些人连年大量施入化肥，导致产量下降。保护地蔬菜连作障害产生的原因主要有以下几种：
1、土壤盐分积累：在保护地生产中，由于一次施用化肥太多，或连续大量施入化肥，作物吸收不完而将多余的肥料残留在土壤中，导致土壤溶液浓度增加，日积月累，使土壤产生次生盐渍化。
2、自害物资积累：根系生长过程中分泌的有毒有害物质得到积累，就会对其生长产生毒害作用。并在同种分泌物下，有些土壤微生物就可能大量繁衍，有些可能被抑制，解除了菌群和菌群之间的相互抑制作用，不利于土壤的熟化和肥料养分的分解，从而导致土壤性能恶化。
3、土传病原菌积累：连作会使同种或同类蔬菜土传病害的病原菌在土壤中越积越多，导致病虫害加重，如枯萎病、霜霉病、叶霉病、灰霉病、根腐病等，从而使生产者只能加大药量和频繁用药来控制，造成对环境和蔬菜的严重污染。
4、土壤中某些营养元素缺乏：由于蔬菜对土壤养分吸收的选择性，单一茬口，易使土壤中矿质元素的平衡状态遭到破坏，营养元素之间的拮抗作用受到影响，容易出现缺素症状，最终使生育受阻，产量和品质下降。
土壤连作障害严重制约了保护地蔬菜的可持续性发展，所以我们应及时的采取防治措施。
