当前的食用菌生产中由于大量使用化学生长促进剂和化学农药，不仅影响了食用菌的生长，而且导致我国食用菌产品中的有毒物质残留量严重超标，极大地影响了其在国际市场上的竞争力。因此，如何搞好无污染、无有毒物质残留的无公害食用菌的生产，是当前食用菌科研和生产中迫切需要解决的问题。
一、防止菌种退化防止菌种退化可以提高产量，减轻病虫害的发生发展，减少农药施用量，是生产无公害食用菌的基础。下面介绍几种防止菌种退化的方法：１．培养菌种的环境温度不能超过28℃。另外，培养好的菌种在常温下存放时间不宜超过半个月。２．切实掌握好培养基出菌时间和温度，防止破坏其营养成分，酸碱度要适宜。３．要经常更换培养基，蛋白胨、麦麸、马铃薯等培养基原料要交替使用。４．原种不要一次用完，应分次取用，余下的低温保存，防止传代过多。
二、综合防治病虫害１．消毒方式的选择：优先采用高压蒸气灭菌法、常压间歇灭菌法、巴氏灭菌法及紫外线灯灭菌法等物理消毒手段。化学消毒优先使用碱类、酚类药物，避免使用重金属盐类等消毒剂。２．处理好原料：食用菌培养料一定要避免受潮霉变滋生害虫；木屑、草料、马粪等的堆藏，下面要垫塑料薄膜或毛毡防潮，上面也要遮盖好以防雨淋或杂物落入；米糠、麸皮、饼料等易生霉菌，应密闭贮藏；培养料要经高温消毒或发酵腐熟，运进菇房后还要进行后期发酵；覆土材料必须经蒸气或福尔马林消毒。３．调整用水量和酸碱度：培养基的水分要适当，酸碱度要适宜，并随时检测、调整。菇房要经常通风，空气相对湿度不宜超过95％。４．采用人工物理方法防治病虫害：防治害虫时尽量采用黑光灯等物理措施；培养料应充分发酵，以杀死线虫和瘿蚊；剔去腐变部位，用石灰水消毒。此外，还要改善环境，调整温度如降低温度防治胡桃内状菌、湿度、如降低湿度防治链孢霉菌、PH值如降低PH值防治白霉菌等。５．严禁使用剧毒农药：不使用有机汞制剂或有机磷制剂或残存时间长、又不易分解且有刺激性臭味的农药，优先使用植物杀虫剂（如除虫菊、鱼藤、烟草浸出液）及微生物杀虫剂（如苏云杆菌和白僵菌）。
三、喷施无污染菇肥１．喷施米醋：在平菇生长中后期用300倍的食用米醋液进行菇面喷施，在采收前1～3天每天１次，一般可增产6％。２．喷施培养料浸出液：取发酵腐熟的干料5公斤，加开水50公斤浸泡，冷却后去渣喷施，可延长出菇高峰期，并使子实体肥厚。３．喷施菇脚水：切取2.5公斤洗净的菇脚加水15公斤，煮15分钟后取其清液，再加水20公斤喷施，可延长出菇高峰期，使子实体肥厚。
