蒜蛆以幼虫危害播后的种子，取食胚乳或子叶，引起种芽畸形、腐烂而不能出苗。较大的植株受到种蝇危害，易受其他病菌侵害而发病。在留种株上危害根部，引起根部腐烂或枯死而造成减产。因此常被作为主要的防治害虫进行预防和治疗。
在播种前或播种期，选择1%阿维菌素颗粒剂或毒死蜱颗粒剂等进行毒土处理，再进行播种，或者播种时选择60%吡虫啉悬浮拌种剂进行拌种，此方式内吸性趋避地蛆，防治效果明显。
田间发现蛆害植株时，可用2.5%高氯或者百树菊酯600~800倍液或22%毒死蜱·吡虫啉1000倍液灌根防治，雨前灌根效果更佳。
